医学系由临床医学、预防医学、口腔医学技术、医学营养专业构建临床医学专业群；临床医学专业群教师教学团队有专任教师24人，其中有副高级以上教师8人，专业带头人5人，具有硕士研究生8人。临床医学专业群教学团队成员先后获得安徽省卓越教学名师、教坛新秀、高校优秀拔尖人才培育资助项目等荣誉，并获批为安徽省教师创新教学团队。《基于医教协同双主体乡村医生培养的实践与创新》获2021年度安徽省教学成果一等奖；《四对接、五协同：“厚德精医”基层卫生健康人才培养体系的构建与实施》荣获2023年度国家教学成果二等奖；临床医学专业群还同时获批为安徽省教师教学团队、安徽省特色高水平专业群2项。2023年主持制订第二批安徽省地方标准制修订项目2项；主持安徽省首批“六百工程”项目职业学校产业专业合作链双链长项目1项；主持安徽省现代职业教育教育体系建设改革重点任务中的临床医学专业乡村医师学院教学资源库、与颍上县人民医院校企合作共建的四业”一体，“1+1+1+1+N”五阶式乡村医生育训并重典型生产实践项目、卫生健康示范性虚拟仿真实训基地项目3项。与重庆三峡医学高等专科学校共同建设国家级《预防医学资源库》建设。2023年获得全国现场救护大赛团体三等奖的好成绩。全国职业院校技能竞赛荣获三等奖两项，安徽省职业院校技能竞赛二等奖一项、三等奖两项、安徽省职业院校技能竞赛教师赛二等奖一项、三等奖一项。

临床医学专业群创新教学团队以临床医学专业国家标准为引领，以乡村医生岗位胜任力需求为导向，工学结合，岗课赛证融通，“三全”育人，校企合作重构修订了人才培养方案及课程标准，构建岗位需求融入以典型工作任务为载体的模块化课程体系，丰富拓展与创新医教协同双主体乡村医生培养的实践，推进了职业技能和职业精神培养高度融合，落实了立德树人的根本任务。优化职业教育类型定位，深化产教融合、校企合作，深入推进育人方式、办学模式、管理体制、保障机制改革，增加职业教育的适用性，助力临床医学高水平专业群建设。现已与省内八家医院一家知名企业开展双主体医（企）教协同办学，实现人才培养供给与市场需求无缝对接，实施“强基础、上平台、铸品牌”三步走战略。为基层人民群众培养出“无病善防、小病善治、慢病善管、重病善转、大病善识”的生命全周期健康全过程的卫生健康守护者。为切实履行服务地方社会与经济发展的任务与使命，医学系临床医学专业群教师教学团队还先后主持了国家、安徽省及多个省级市的“三医”改革课题。